政府否認文德麟醫生11月21日在《刺針》網頁發表題為《香港違反國際人道主義準則》文章的指控，政府在理工大學事件中，一直以傷者的福祉和安全為首要考慮。
政府指出，評論事件需了解其背景。文德麟醫生11月17日到達理大時，暴力示威和暴動已在理大校園、周圍和本港多處持續五日，並不斷升級。政府當時採取和平及靈活的方式解決在理大的對峙局面。
當時暴徒和激進示威者已控制校園及附近範圍，他們在天橋和收費亭縱火，向警方投擲汽油彈，用高壓彈叉發射石頭和金屬物件。校園受到大規模破壞，校內實驗室有危險化學品被偷去。暴徒和激進示威者在校園製造大量汽油彈，甚至把汽油彈和危險化學品偷運出校園，情況非常危險，對公眾安全構成嚴重威脅。
暴徒和其他逗留在校園的人士，包括傳媒及急救人員，多次被要求並給予機會和平離開校園。雖然很多人離開，但仍有不少人留守。未滿18歲人士在提供個人資料後可離開，警方不會即時拘捕，但保留追究權利。11月17日晚上，大批人士離開校園並被拘留。
假扮急救人員或記者以逃避拘留或拘捕是暴徒常用手法。由於有大批人士離開校園，加上情況混亂，警方曾拘留聲稱是急救人員或記者的人士以確認身分。能提供有效身分證明者可離開，未能提供證明者則被拘捕。被捕人士中有12人自稱急救人員但未具相關急救資格，也不是在醫療機構工作；另有七人自稱記者但未能提供證明。
文德麟醫生亦承認警方曾建議救護人員進入事發現場，但示威者因擔心被捕而拒絕。11月18日上午，警方安排香港紅十字會志願醫療團隊進入校園。他們於下午2時抵達並提供急救服務，與文德麟醫生的指控相反，救援工作並沒有受到延誤或時間限制。
香港紅十字會11月22日的聲明已澄清，在進入理大前已與各方商討及協調，並得到配合，該會急救團隊順利進入校園提供服務，過程中並無受到任何延誤、阻撓或不禮貌對待。
此外，警方安排救護車和其他團體包括無國界醫生的義工在理大校園及附近一帶提供醫療或急救服務。醫院管理局亦密切監察狀況，確保公立醫院急症室在需要時迅速提供服務。
各急症室11月19日上午從校園共接收約80名傷者。當日中午，現場仍有約100名傷者。醫管局派出緊急醫療小組到場評估情況，最終安排約200名傷者送往12間公立醫院接受治療，大部分傷者情況穩定。
在整件事件，政府領導層和提供緊急服務的部門與多方合作，包括大學職員、中學校長、社區和宗教領袖、社工，呼籲示威者和傷者和平地離開校園和尋求治療。
